O Departamento de Biologia e Ciências do Colégio Pedro II possui em seu corpo docente em torno de 90 professores, que atendem alunos do 6ª ao 9ª ano do Ensino Fundamental (disciplina Ciências), da 1ª a 3ª série do Ensino Médio Regular e Técnico (disciplina Biologia e específicas do Curso Técnico em Meio Ambiente), ou participam diretamente de funções administrativas/pedagógicas.
Dentre estes profissionais, aproximadamente 50% possui regime de trabalho de Dedicação Exclusiva ao Colégio e mais de 85% possuem curso de pós-graduação, em nível de Especialização, Mestrado e/ou Doutorado.
O Departamento de Biologia tem sob sua coordenação o Curso Técnico Integrado em Meio Ambiente, oferecido no Campus São Cristóvão III, cujo objetivo é formar profissionais de nível médio que possam se inserir diretamente no mercado de trabalho na área ambiental.
O departamento é também responsável pela gestão do Horto Botânico do Colégio Pedro II, localizado no Complexo São Cristóvão. Conhecido pela comunidade escolar como “Área Verde”, o espaço destina-se ao desenvolvimento de atividades de iniciação científica pelos alunos do Ensino Médio e à visitação de todo corpo docente e discente, visto que se constitui em excelente ambiente para atividades diversas, pertinentes às diferentes disciplinas.